曾元琦是國立清華大學AMIS Fellows的專任副教授。創立並主持Inclusive Inter-Intelligence Design Lab (iiiD-Lab)。在清華大學內,他協助許多在設計、創新創業教育、以及設計和數位教育轉型等工作。目前是創新設計學分學程召集人,以及清華學院學士班-創新設計組的召集人。此外,他也擔任清華書院-載物書院的執行長。
曾元琦的學術背景和研究興趣融合了《設計》、《人文與社會科學》、以及《互動科技與科學》。他曾任職於英國倫敦大學學院互動研究中心UCLIC(訪問教授,2023年2月至2023年8月)、國立清華大學工業工程與工程管理學系(合聘副教授,2019年8月至今)、國立清華大學服務科學研究所(副教授,2018年8月至2024年1月)、國立成功大學工業設計系(助理/副教授,2011年至2018年)、美國SKERI視覺科學研究所(Rachel C. Atkinson Postdoctoral Fellow,2010年至2011年)、美國伊利諾伊大學香檳分校心理學系(博士後,2008年至2010年)以及美國耶魯大學醫學院(訪問學者 in Professor Chiang-Shan Ray Li's Lab,2010年)等地。
曾元琦目前擔任人機互動頂尖期刊《 International Journal of Human-Computer Studies》的副主編(2023年6月至今)。
曾元琦創立了iiiD-Lab,旨在開發能夠以負責任的方式促進各種智慧形式之間互動的系統和技術,其中包括人類智慧、認知、人工智慧 (AI) 以及其他潛在的多樣智慧形式。作為一位專注於人機互動、人工智慧、心理學和社會科學的研究員和設計師,他的研究主要集中在推動人本AI的發展,並開發促進包容性數位健康、加強創意團隊協作、改善人工智慧與人類互動,以及優化使用者體驗和效益的工具、技術和服務系統。他的設計主要目標在於透過科技促進各種利害關係人和專業人士之間的溝通和合作,以提供更好的服務,並滿足個人、社區和社會的全面需求。由於他跨領域的學術背景,他的研究成果已在各個領域的頂尖期刊和國際會議上發表,包括醫學資訊、人機互動、人工智慧、實驗和認知心理學、行為神經科學、醫學、神經學、教育科學等。這些研究成果也使他獲得了國家科學及技術委員會的《吳大猷紀念獎》、多項最佳論文獎,以及 ACM CSCW 2023 論文表彰其研究在多元性和包容性的貢獻。