曾元琦的服務領域廣泛，涵蓋政府部門與學術機構，展現出對學術、教育與實務發展的高度投入。他致力於推動跨領域創新研究，並積極參與教育體系的改進與發展，期望為知識創新與社會進步作出深遠的貢獻。

國立清華大學 (2018~)

• 清華書院 — 院長 (2024.11 ~ present)
• 清華書院：載物書院 — 執行長 (2020.08 ~ present)
• 清華大學「創新設計學分學程Innovative Design Program」 — 召集人 (2020.04 ~ present)
• 清華學院學士班不分系創新設計組 — 甄審召集人 (2020.04 ~ present)
• 清華學院學士班不分系創新設計組 — 甄審委員 (2019.04 ~ present)
• 科管院「新興科技與數位教育推動辦公室」 — 主任 (2020.04 ~ 2024.01)
• 教務處教發中心-學習促進與研究規劃組 — 組長 (2019.02 ~ 2020.07)

國科會 (科技部):

• 國科會人文司「藝術學門」複審委員 (2023.01 ~ present)
• 國科會人文司「工工學門」複審委員 (2022.01 ~ 2024.12)
• 國科會人文司「數位環境下青少年議題研究諮詢會議」 — 諮詢委員 (2024.02.06)
• 科技部工程司「工工學門」前瞻議題與新興科技子學門 — 召集人&規劃委員 (2020.01 ~ 2022.12)
• 國科會人文司「藝術學門」複審委員 (2018.01 ~ 2020.12)
• 國科會人文司「工工學門」複審委員 (2018.01 ~ 2020.12)
• 科技部工程司「工工學門」 — 2032展望規劃委員 (2017.01~2019.12)

衛福部國民健康署:

• 國健署健康九九+網站維運計畫1之「網站使用者研究方法設計與分析工作項目」，詮識科技-諮詢顧問 (2024.04~2024.12)
• 「健康九九網站」使用者經驗(UX)與使用者介面(UI), 衛福部國健署-專家會議委員 (2021)
• 「108年建構智慧健康城市計畫」臺北市試辦場域實地輔導訪視— 訪視委員 (2019.07)
• 「108年建構智慧健康城市計畫」苗栗縣試辦場域實地輔導訪視— 訪視委員 (2019.05)

教育部：

• 「114年留學獎學金甄試【建築、規劃與設計學群】學門C組」,書面審查委員暨主任委員(2025.04)
• 「113年留學獎學金甄試【建築、規劃與設計學群】學門C組」,書面審查委員暨主任委員(2024.04)
• 「110年留學獎學金甄試【建築、規劃與設計學群】學門C組」,書面審查委員 (2021.04)
• 「109年留學獎學金甄試【建築、規劃與設計學群】學門C組」,書面審查委員 (2020.04)
• 「108年公費留學考試【建築、規劃與設計學群】」, 面試委員 (2019.11)
• 「105年留學考試」命題及閱卷委員 (2016.09)
• 「教學實踐研究計畫案件，審查委員(2019.02~present)

經濟部：

• 113年度經濟部硏究機構創業潛力獎初審(服務領域) (TREE Award), 經濟部產業技術司, 專家委員 (2024.04)
• 國際貿易局「第28屆台灣精品獎選拔」, 副審查委員 (2019.05)

台灣少年權益與福利促進聯盟：

• 數位衝擊手冊總編審會議 — 編審委員 (2024.10~2024.12)